เนื้อเรื่องของเกม Bomberman Fantasy Race เล่าถึงการแข่งรถในดินแดนแฟนตาซี ซึ่งตัวละครต่างๆ ที่มาจากจักรวาล Bomberman จะเข้าร่วมการแข่งขันที่เรียกว่า Fantasy Race โดยในการแข่งขันนี้ไม่ใช่แค่ความเร็วที่สำคัญ แต่ยังต้องใช้กลยุทธ์และทักษะในการวางระเบิด (Bombs) เพื่อขัดขวางคู่แข่งและทำลายอุปสรรคที่อยู่ในเส้นทาง ตัวละครหลักในเกม ได้แก่ Bomberman และตัวละครอื่นๆ ที่มีความสามารถพิเศษแตกต่างกันไป ตัวละครแต่ละตัวจะมีสไตล์การขับขี่และความสามารถเฉพาะตัวที่สามารถใช้ในการแข่ง เช่น การวางระเบิดเพื่อขัดขวางคู่แข่ง, การใช้ไอเทมพิเศษ หรือการหลบหลีกอุปสรรคต่างๆ ในสนามแข่ง