Dark Prison เป็นเกมที่เกิดขึ้นในจักรวาลของ Super Robot Taisen Original Generation (OG) โดยเน้นการพัฒนาเรื่องราวจากภาคหลัก และมุ่งเน้นการต่อสู้ระหว่างกลุ่มพันธมิตรของหุ่นยนต์ที่แตกต่างกัน รวมถึงการเผชิญหน้ากับความมืดที่คุกคามโลก ตัวละครหลักคือ Kyosuke Nanbu และ Ryusei Date จากทีม Granteed ซึ่งเป็นหน่วยปฏิบัติการพิเศษที่ได้รับมอบหมายให้ปราบปรามภัยคุกคามจากกลุ่มศัตรูที่เรียกว่า Dark Prison กลุ่มนี้เป็นการรวมตัวขององค์กรที่มีเป้าหมายในการทำลายล้างโลกและเปิดประตูสู่มิติอื่น การดำเนินเรื่องจะเน้นไปที่สงครามระหว่างฝ่ายต่างๆ พร้อมกับการแก้ไขปัญหาความขัดแย้งภายในกลุ่มพันธมิตรที่คอยปกป้องโลก ตัวละครแต่ละตัวจะมีการพัฒนาความสัมพันธ์และเรื่องราวที่ซับซ้อน ซึ่งจะเป็นส่วนสำคัญในการเปิดเผยความจริงเกี่ยวกับศัตรูที่พวกเขาต่อสู้ด้วย.