Mortal Kombat 2 (1993) มีการเชื่อมโยงจากภาคแรก และมีการขยายความลึกของจักรวาล Mortal Kombat โดยเรื่องราวหลักของภาคนี้ยังคงเน้นไปที่การต่อสู้ในทัวร์นาเมนต์ Mortal Kombat ที่จัดขึ้นเพื่อการครองโลกและพลังของมัน ภาคนี้เพิ่มองค์ประกอบใหม่ๆ ในการสู้รบและขยายเนื้อหาของจักรวาลเกมไปอีกขั้น ซึ่งต่อยอดจากเหตุการณ์ในภาคแรก Shang Tsung และ Emperor Shao Kahn: แม้ว่าจะพ่ายแพ้ในการแข่งขัน Mortal Kombat ครั้งแรกในโลก Earthrealm, Shang Tsung ผู้เป็นพ่อมดลัทธิและผู้จัดการแข่งขัน ยังได้รับคำสั่งจาก Emperor Shao Kahn ผู้ปกครองจาก Outworld ให้จัดการแข่งขันใหม่ใน Mortal Kombat 2 เพื่อที่ Outworld จะได้พิชิต Earthrealm ในที่สุด. นอกจากนี้, Shao Kahn ยังมีแผนที่จะใช้การต่อสู้ใน Mortal Kombat เพื่อเปิดช่องทางการรวมโลก Earthrealm กับ Outworld เข้าด้วยกัน  Mortal Kombat 2 จึงเกี่ยวข้องกับการคุกคามของ Outworld ที่พยายามจะครอบครอง Earthrealm ผ่านการจัดการแข่งขัน Mortal Kombat ครั้งที่สอง โดยมีตัวละครหลักจากทั้งสองโลกเข้ามามีบทบาทในการต่อสู้เพื่อปกป้องหรือทำลายล้างโลกของตนเอง.