เรื่องราวของ Eliwood เกิดขึ้นหนึ่งปีหลังจากเหตุการณ์ในเรื่องของ Lyn

หนึ่งเดือนก่อนที่เรื่องราวจะเริ่มต้น ลอร์ดเอลเบิร์ต (Elbert) มาร์ควิสแห่ง Pherae ผู้เป็นพ่อของ เอลิวูด (Eliwood) ได้หายตัวไประหว่างเดินทางไปต่างประเทศ พร้อมกับข้ารับใช้คนสำคัญของเขาหลายคน ด้วยความกังวลใจ Eliwood จึงออกเดินทางเพื่อตามหาพ่อของเขา โดยมี มาร์คัส(Marcus) พาลาดินผู้ภักดีของครอบครัว และ โลเวน(Lowen) อัศวินฝึกหัดจาก Pherae ร่วมเดินทางไปด้วย

ในการค้นหาเบาะแส Eliwood เดินทางออกจาก Pherae ขณะเดียวกัน เฮคเตอร์ (Hector) เพื่อนสนิทของเขา แอบหนีออกจาก Ostia เพื่อติดตามไปช่วย พวกเขาเดินทางไปยัง Santacruz เพื่อพบกับ Helman มาร์ควิสแห่งเมือง และสอบถามข้อมูลเกี่ยวกับที่อยู่ของ Elbert อย่างไรก็ตาม เมื่อพวกเขามาถึง Helman ได้รับบาดเจ็บสาหัสจากน้ำมือของ Ephidel สมาชิกของกลุ่ม Black Fang ก่อนสิ้นใจ Helman ใช้ลมหายใจสุดท้ายบอกให้ Eliwood เดินทางไปหา Darin มาร์ควิสแห่ง Laus

เมื่อ Eliwood และ Hector ไปถึง Laus พวกเขากลับถูกโจมตีโดยกองกำลังของ Darin และลูกชายของเขา Erik Darin หนีไปก่อนที่จะถูกจับ ทิ้งให้ Erik เผชิญหน้ากับพวกเขา หลังจากพ่ายแพ้ Erik เปิดเผยว่า Ephidel คือชายลึกลับที่อยู่เบื้องหลังแผนการของพ่อเขา Eliwood จึงไล่ตาม Darin และ Black Fang ต่อไป จนกระทั่งไปถึง Caelin ซึ่งกำลังถูกโจมตีโดย Black Fang ที่นั่นเขาได้ช่วยปกป้องเมืองและได้ Lyn มาเป็นพันธมิตร

ในขณะเดียวกัน Nergal ผู้อยู่เบื้องหลังกลุ่ม Black Fang พยายามบังคับให้ Ninian ใช้พลังของ Elbert เพื่อเปิด "ประตูมังกร"

Leila สายลับจาก Ostia ที่แฝงตัวอยู่ใน Black Fang เปิดเผยว่า Darin และกลุ่มศัตรูได้หลบหนีไปยัง Dread Isle Eliwood จึงมุ่งหน้าไปยัง Badon เพื่อหาทางข้ามไปยังเกาะแห่งนั้น แม้ในตอนแรกจะถูกปฏิเสธเพราะชื่อเสียงอันเลวร้ายของ Dread Isle แต่ในที่สุด Fargus กัปตันโจรสลัดก็ตกลงช่วยพาพวกเขาไป

เมื่อไปถึง Dread Isle Eliwood ต้องต่อสู้ฝ่ากองกำลังของ Black Fang และได้เผชิญหน้ากับ Ninian อีกครั้ง เขาสังหาร Darin และในที่สุดก็ค้นพบว่าพ่อของเขา Elbert อยู่ในเงื้อมมือของ Nergal

Nergal พยายามเปิดประตูมังกรโดยใช้ Quintessence ของ Elbert แต่ถูกขัดขวางโดย Nils ส่งผลให้ประตูเปิดได้ไม่สมบูรณ์ และมังกรที่พยายามจะออกมากลับถูกทำลายไปพร้อมกับ Ephidel ที่ยืนอยู่ใกล้ๆ Nergal ปรากฏตัวอีกครั้งหลังจากประตูสงบลง แต่ Elbert ใช้พลังเฮือกสุดท้ายทำร้ายเขาจนต้องล่าถอยไป อย่างไรก็ตาม Elbert ได้รับบาดเจ็บสาหัสและสิ้นใจในอ้อมแขนของ Eliwood

หลังจากสูญเสียพ่อไป Eliwood และพวกพ้องออกเดินทางกลับ Pherae เพื่อวางแผนรับมือกับภัยร้ายที่กำลังจะมาถึง